立體顯微鏡能讓我們看見物體表面的細節，並呈現立體感，適合觀察昆蟲、植物、礦石及電子零件。它的放大倍率通常較低，操作空間較大，多數樣本不必切成薄片，就能直接觀察。除了科學教學，也常用於零件檢查、精細組裝與維修。